Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms