Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upp2Q8CGR7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms