Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CDS7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CDS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms