Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx1bQ8BX32 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx1bQ8BX32 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms