Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SprnQ8BWU1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SprnQ8BWU1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms