Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtpaQ8BWP5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms