Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup54Q8BTS4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup54Q8BTS4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms