Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR90

UPF0600 protein C5orf51 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BR90 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BR90 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BR90 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BR90 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BR90 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BR90 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BR90 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BR90 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms