Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hirip3Q8BLH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hirip3Q8BLH7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms