Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms