Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms