Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms