Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prima1Q810F0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms