Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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