Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ttc28Q80XJ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms