Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed4Q80WQ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Zbed4Q80WQ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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