Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
NischQ80TM9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NischQ80TM9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
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