Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdc42bpbQ7TT50 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms