Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms