Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrc2bQ7TPM1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms