Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms