Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwistnbQ78WZ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms