Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme8Q715T0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme8Q715T0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms