Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SynmQ70IV5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms