Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup188Q6ZQH8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms