Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ift172Q6VH22 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms