Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms