Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54bQ6PFE3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms