Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc85bQ6PDY0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms