Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp49Q6P9L4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp49Q6P9L4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp49Q6P9L4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp49Q6P9L4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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