Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms