Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms