Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SphkapQ6NSW3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms