Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo41Q6NS60 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms