Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd11Q6NS46 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd11Q6NS46 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms