Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc66Q6NS45 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms