Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edrf1Q6GQV7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edrf1Q6GQV7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms