Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf8Q6DID3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms