Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Smarca2Q6DIC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms