Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sv2cQ69ZS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sv2cQ69ZS6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms