Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd6Q69ZL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms