Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms