Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ric1Q69ZJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ric1Q69ZJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ric1Q69ZJ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms