Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms