Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc8eQ66JT1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms