Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms