Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim24Q64127 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms