Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms