Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn1Q62261 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms