Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SspnQ62147 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SspnQ62147 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SspnQ62147 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SspnQ62147 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms